Аномалии развития половых органов у женщин чаще всего бывают эмбрионального происхождения.
Период эмбриогенеза, от 3-й до 12-й недели с момента оплодотворения, когда закладываются все основные органы, является наиболее чувствительным периодом к вредному воздействию различных факторов, способствующих аномалиям развития вообще и половых органов в частности.
К этиологическим моментам, способствующим возникновению аномалий в развитии эмбриона, относятся наследственные факторы и экзогенные воздействия.
К последним принадлежат некоторые вирусные заболевания, возникающие у беременной в первые недели беременности (краснуха, корь, оспа), паразитарные (токсоплазмоз), диабет, нарушения гормонального взаимоотношения между организмом матери и плода, недостаточное поступление кислорода и витаминов к эмбриону и ионизирующие излучения, воздействующие на беременную.Значительно реже аномалии развития половых органов бывают приобретенными во внеутробной жизни. Зачастую трудно бывает решить вопрос о характере происхождения того или другого вида недоразвития или порока развития половых органов. Нередко пороки развития половых органов сочетаются с аномалиями мочевой системы (почки, почечные лоханки, мочеточники, мочевой пузырь) и с аномалиями костной системы (позвоночник).